鹿邑县中医院始建于1988年，是鹿邑县唯一一所二级中医医院，是全县医疗卫生服务体系的重要组成部分，也是鹿邑县中医工作的龙头单位。承担着全县中医药预防保健、基本医疗、农村适宜技术推广、乡村两级卫生机构中医药人员技术培训及业务指导等任务。我院于与鹿邑县原中心医院正式合并，老址位于县城真源大道南段，现总占地112.77亩，建筑面积7242m2，固定资产1687万元。编制床位600张。现有职工总人数366人。有卫生专技人员189人，高级职称25人、中级职称70人，建院30年来，通过全院干部职工的不懈努力，医院逐步发展成为具有鲜明中医药特色的中医医院。

中医院新址位于县城西关新区，原县中心医院东侧，311国道北。占地总面积38.64亩，病房医技楼建筑面积20763.68平方米，16层(包括地下一层)，加上二次装修及配套工程，总投资近9800万元，目前已投入使用。医院设有神经内科、心血管内科、肛肠科、骨伤科、精神病科等专科列为重点中医专科建设，医院制定并实施了卒中、精神病、肛肠、骨伤等专科建设发展规划，5个专科具有明显的中医药特色优势，各专科制定了相应的中医诊疗方案，对临床科室定期加以评价、分析，不断提高专科水平。2018年我院肛肠科作为河南省中医药管理局确定的河南省特色中医专科，目前该项目正按计划、有步骤建设中。外科开展腹腔镜微创手术等多项手术，已成为医院品牌科室。妇产科开展中医助孕、新法接生、无疼分娩，广大孕产妇有口皆碑。为响应国家及省卫健委精神，按照县委县政府安排，鹿邑县中医院医疗健康集团已经成立。由中医院牵头，十个乡镇卫生院参与，及所辖村卫生室组成鹿邑县中医院紧密型医共体，下辖57万人口。同时充分利用真源医院管理、人才、设施等资源方面的优势，与中医院形成优势互补。医共体牵头医疗机构重点承担急危重症患者的救治，初步建立起县乡村一体化运作的医疗卫生服务体系，医共体管理制度和运行机制基本建立并逐步完善。